Tenho conseguido configurar com sucesso o arquivo de proxy em /etc/apt/apt.conf.d para acessar uma rede com proxy e autenticação.
Para que o APT funcione nesta rede, é necessário a configuração de proxy.
Contudo tenho um problema ainda. Preciso fazer essa configuração usando uma interface gráfica. No Ubuntu é possível configurar proxy na opção Rede, mas não é opção incluir usuário e senha para autenticação.
Há pessoas utilizando esta rede e outras sem proxy que precisam a todo instante alterar estar configurações e não tem ainda conhecimento para realizar procedimentos com este nível de dificuldade.