@marcusdesa, façamos assim então: instale o Ubuntu no disco que pretende instalar e escolha o iniciador (grub) nesse mesmo disco; Na BIOS ponha o computador a arrancar por esse mesmo disco!
Tenho a certeza que vai funcionar! E o Grub vai detetar na mesma o Windows por isso os problemas ficam resolvidos. O Grub só não deteta o Windows caso você instale o Ubuntu com o Windows hibernado, por isso não hiberne.